はじめに　近藤　格

プロテオーム解析による疾患研究
　次世代DIA ショットガン解析およびプロテオジェノミックス－肺癌サブタイプの臨床プロテオーム解析を出発点として　西村俊秀
　プロテオーム解析を利用した臨床細菌検査　野村文夫
　プロテオミクス，グライコミクス，そしてグライコプロテオミクスの時代へ　成松　久
　腎疾患のプロテオーム解析　山本　格
　プロテオーム解析を基盤とした融合的オミクス解析による脳神経系腫瘍の解析　小林大樹・荒木令江
　肉腫のプロテオーム解析　近藤　格・川井　章
　疾患抗体マーカーの開発　日和佐隆樹
　リウマチ性疾患のプロテオーム解析　黒川真奈絵・浅野孝太

疾患研究に応用されるプロテオーム解析
　疾患研究における翻訳後修飾のプロテオーム解析　木村鮎子・平野　久
　定量的プロテオミクス技術の疾病診断への応用　朝長　毅・他
　エクソソームのプロテオーム解析によるバイオマーカー開発　植田幸嗣
　臨床材料を用いたアレイ基盤プロテオミクスを用いた創薬標的・バイオマーカーの開発　小林　信・他
　プロテオーム解析システム2DICAL を用いたバイオマーカー開発　尾野雅哉
　血清バイオマーカー開発のためのサンプル調製　小寺義男
　アガロース二次元電気泳動法の疾患プロテオミクスへの応用　大石正道
　逆相タンパクアレイ技術のがん研究への応用　西塚　哲
　PROTOMAP 法を用いたプロテオーム解析　中山　洋・他
　質量顕微鏡を用いた腫瘍組織内の薬物分布情報のイメージング　新間秀一
　ペプチドミクス－内因性分泌ペプチドの一斉解析から新規生理活性ペプチドの発見へ　佐々木一樹
　抗体プロテオミクス技術を用いた疾患バイオマーカーの開発　鎌田春彦・他
　網羅定量プロテオーム解析（FD-LC-MS/MS 法）によるバイオマーカー探索　今井一洋・一番ヶ瀬智子

■サイドメモ目次
　FFPE 組織を用いるMS-based ショットガン・プロテオーム解析
　ヒト腎・尿プロテオームプロジェクト
　尿バンク
　iTRAQ
　融合プロテオミクス解析のために作成した統合プログラムiPEACH/MANGO によって自動的に解析ファイルを統合する一連の方法
　融合プロテオミクスの検証ツールとしての全自動二次元電気泳動Western blotting 装置
　二次元電気泳動法とショットガン法
　SRM/MRM 法
　iTRAQ 法
　ショットガンプロテオミクス
　タンデムマス
　マトリックス
　質量顕微鏡
　ヒトプロテオームプロジェクト（HPP）
　特徴的タンパク質
　培養液タンパク質　補遺